好气性细菌会以嫌气性细菌的10倍速度分解有机物。细菌又分高温和低温微生物二种，这两种细菌交替出现和消失。分解有机物分三个时期。前熟期:20至40摄氏度时，细菌分解有机质中的糖类氨基酸等容易分解的物质。随着有机物质分解，细菌大量繁殖，呼吸作用旺盛，使温度上升，上升至60至80℃时，低温细菌被高温细菌代替。纤维素分解期:高温细菌有好气性和嫌气性二种。纤维素被一层木质壳包围，当温度到达70至80摄氏度时，这个壳被高温好气性细菌和放线菌破坏，暴露出来的纤维素，在嫌气条件下，被分解成有机酸和能源。

木质素分解期:主要在温度从80℃下降至40℃时进行，在磨茹菌参加下，发酵成黑褐色细片。因发酵物质被分解时，各种微生物交替出现或死亡。一次发酵不能把整堆的物质转化完全，故要重复3至5。堆料中常常遇到以下几种情况。下雨:饲料过湿会使养分流失。注意透气，否则堆内有毒气体散不出去。

粪多:料堆压得太紧，透气不良。料温升不高。草多粪少:堆的太松，水分蒸发快，料过干，温度升不。调节:堆内在高温条件下，产生放线菌，应加水调节。基料黑、粘、臭：这主要是粪类太多、过湿、过紧、不透气造成的。粪类腐烂，有毒气:这主要是前期温度升不高，应即时翻堆改善。料轻、松、碎:这主要是养分消耗过多，引起发酵过了头了。

4.饲料堆的制作:可直接用基料的堆制法制作，发酵次数仅需2至3次就可使纤维分解完全，即可使用。把那些未熟透的纤维拣出来重新发酵，亦可以直接用牛粪、猪粪堆制发酵，时间10至20天，翻动一次就可使用，料宜偏干。堆制时，需用木棍在料堆上面戮几个洞，改善供氧，排出有毒气体，促进熟化。